Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCN11AQ9UI33 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms