Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
IFT172Q9UG01 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
IFT172Q9UG01 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms