Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
USP36Q9P275 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
USP36Q9P275 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms