Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA2D2Q9NY47 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms