Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL28Q9NXS3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms