Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP2

CMC2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC2Q9NRP2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMC2Q9NRP2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms