Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD0

FBXO8, F-box only protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO8Q9NRD0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO8Q9NRD0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO8Q9NRD0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO8Q9NRD0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO8Q9NRD0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO8Q9NRD0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO8Q9NRD0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO8Q9NRD0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO8Q9NRD0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO8Q9NRD0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO8Q9NRD0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO8Q9NRD0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO8Q9NRD0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO8Q9NRD0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO8Q9NRD0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO8Q9NRD0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO8Q9NRD0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO8Q9NRD0 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO8Q9NRD0 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO8Q9NRD0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO8Q9NRD0 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO8Q9NRD0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO8Q9NRD0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO8Q9NRD0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO8Q9NRD0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO8Q9NRD0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO8Q9NRD0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FBXO8Q9NRD0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
FBXO8Q9NRD0 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FBXO8Q9NRD0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FBXO8Q9NRD0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FBXO8Q9NRD0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FBXO8Q9NRD0 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FBXO8Q9NRD0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FBXO8Q9NRD0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FBXO8Q9NRD0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FBXO8Q9NRD0 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FBXO8Q9NRD0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms