Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 LINC02001-202ENST00000638682 1504 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 RPL35A-206ENST00000464167 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 EMC4-202ENST00000267750 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 AL049840.6-202ENST00000603373 279 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 AC003075.1-208ENST00000415246 596 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 SEPT7P2-208ENST00000444755 505 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 S100Z-202ENST00000513010 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SENP3Q9H4L4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms