Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTRT3Q9BYD9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms