Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMAD5Q99717 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms