Protein–RNA interactions for Protein: Q99607

ELF4, ETS-related transcription factor Elf-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF4Q99607 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms