Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMD1Q99460 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms