Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IPQ96QF0 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms