Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARF2Q96GP6 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms