Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRC59Q96AG4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms