Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3AQ92664 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms