Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NEDD1Q8NHV4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms