Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHCHD4Q8N4Q1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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