Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW6

N4BP2, NEDD4-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP2Q86UW6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
N4BP2Q86UW6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
N4BP2Q86UW6 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
N4BP2Q86UW6 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
N4BP2Q86UW6 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
N4BP2Q86UW6 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
N4BP2Q86UW6 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
N4BP2Q86UW6 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
N4BP2Q86UW6 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
N4BP2Q86UW6 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
N4BP2Q86UW6 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
N4BP2Q86UW6 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
N4BP2Q86UW6 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
N4BP2Q86UW6 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
N4BP2Q86UW6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
N4BP2Q86UW6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
N4BP2Q86UW6 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
N4BP2Q86UW6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
N4BP2Q86UW6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
N4BP2Q86UW6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
N4BP2Q86UW6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
N4BP2Q86UW6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
N4BP2Q86UW6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
N4BP2Q86UW6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
N4BP2Q86UW6 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
N4BP2Q86UW6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
N4BP2Q86UW6 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
N4BP2Q86UW6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
N4BP2Q86UW6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
N4BP2Q86UW6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
N4BP2Q86UW6 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
N4BP2Q86UW6 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
N4BP2Q86UW6 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
N4BP2Q86UW6 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
N4BP2Q86UW6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
N4BP2Q86UW6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
N4BP2Q86UW6 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
N4BP2Q86UW6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
N4BP2Q86UW6 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms