Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWW1

C1QL3, Complement C1q-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QL3Q5VWW1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms