Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC93Q567U6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC93Q567U6 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms