Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B3Q16720 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP2B3Q16720 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
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