Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RABEP1Q15276 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RABEP1Q15276 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms