Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
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PTPRKQ15262 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
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PTPRKQ15262 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRKQ15262 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
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PTPRKQ15262 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
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PTPRKQ15262 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
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PTPRKQ15262 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
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PTPRKQ15262 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
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PTPRKQ15262 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
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PTPRKQ15262 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
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PTPRKQ15262 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRKQ15262 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
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