Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCINQ13939 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCINQ13939 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCINQ13939 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCINQ13939 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCINQ13939 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCINQ13939 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCINQ13939 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCINQ13939 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCINQ13939 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCINQ13939 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCINQ13939 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCINQ13939 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCINQ13939 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCINQ13939 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCINQ13939 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCINQ13939 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCINQ13939 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCINQ13939 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCINQ13939 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCINQ13939 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCINQ13939 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCINQ13939 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCINQ13939 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCINQ13939 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCINQ13939 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCINQ13939 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCINQ13939 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCINQ13939 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCINQ13939 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCINQ13939 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCINQ13939 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCINQ13939 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCINQ13939 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCINQ13939 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCINQ13939 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCINQ13939 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCINQ13939 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCINQ13939 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCINQ13939 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCINQ13939 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCINQ13939 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCINQ13939 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCINQ13939 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCINQ13939 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCINQ13939 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCINQ13939 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCINQ13939 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCINQ13939 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCINQ13939 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCINQ13939 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCINQ13939 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCINQ13939 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCINQ13939 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCINQ13939 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCINQ13939 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCINQ13939 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCINQ13939 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCINQ13939 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCINQ13939 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCINQ13939 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCINQ13939 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCINQ13939 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCINQ13939 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCINQ13939 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCINQ13939 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCINQ13939 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCINQ13939 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCINQ13939 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCINQ13939 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCINQ13939 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCINQ13939 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCINQ13939 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCINQ13939 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCINQ13939 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCINQ13939 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCINQ13939 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCINQ13939 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCINQ13939 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCINQ13939 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCINQ13939 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCINQ13939 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCINQ13939 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCINQ13939 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCINQ13939 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCINQ13939 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCINQ13939 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCINQ13939 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCINQ13939 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCINQ13939 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCINQ13939 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCINQ13939 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCINQ13939 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCINQ13939 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCINQ13939 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCINQ13939 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCINQ13939 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCINQ13939 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCINQ13939 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCINQ13939 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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