Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
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