Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATMQ13315 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATMQ13315 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATMQ13315 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATMQ13315 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATMQ13315 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATMQ13315 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATMQ13315 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATMQ13315 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATMQ13315 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATMQ13315 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATMQ13315 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATMQ13315 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATMQ13315 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATMQ13315 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATMQ13315 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATMQ13315 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATMQ13315 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATMQ13315 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATMQ13315 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATMQ13315 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATMQ13315 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATMQ13315 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATMQ13315 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATMQ13315 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATMQ13315 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATMQ13315 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATMQ13315 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATMQ13315 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATMQ13315 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATMQ13315 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATMQ13315 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATMQ13315 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATMQ13315 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATMQ13315 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATMQ13315 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATMQ13315 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATMQ13315 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATMQ13315 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ATMQ13315 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATMQ13315 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATMQ13315 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATMQ13315 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ATMQ13315 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATMQ13315 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATMQ13315 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATMQ13315 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMQ13315 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMQ13315 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMQ13315 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMQ13315 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMQ13315 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMQ13315 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMQ13315 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMQ13315 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMQ13315 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMQ13315 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMQ13315 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMQ13315 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMQ13315 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMQ13315 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMQ13315 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMQ13315 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMQ13315 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMQ13315 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMQ13315 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMQ13315 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMQ13315 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMQ13315 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMQ13315 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMQ13315 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMQ13315 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMQ13315 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMQ13315 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMQ13315 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMQ13315 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMQ13315 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMQ13315 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMQ13315 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMQ13315 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMQ13315 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMQ13315 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMQ13315 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMQ13315 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMQ13315 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMQ13315 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMQ13315 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMQ13315 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMQ13315 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMQ13315 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMQ13315 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMQ13315 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMQ13315 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMQ13315 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMQ13315 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMQ13315 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMQ13315 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMQ13315 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMQ13315 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATMQ13315 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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