Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
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