Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNG1Q06432 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms