Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OC90Q02509 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OC90Q02509 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OC90Q02509 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OC90Q02509 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OC90Q02509 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OC90Q02509 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OC90Q02509 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OC90Q02509 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OC90Q02509 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OC90Q02509 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OC90Q02509 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OC90Q02509 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OC90Q02509 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OC90Q02509 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OC90Q02509 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OC90Q02509 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OC90Q02509 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
OC90Q02509 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OC90Q02509 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
OC90Q02509 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OC90Q02509 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
OC90Q02509 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OC90Q02509 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OC90Q02509 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OC90Q02509 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OC90Q02509 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OC90Q02509 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OC90Q02509 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OC90Q02509 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OC90Q02509 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OC90Q02509 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OC90Q02509 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OC90Q02509 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OC90Q02509 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OC90Q02509 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OC90Q02509 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OC90Q02509 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OC90Q02509 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OC90Q02509 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OC90Q02509 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OC90Q02509 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OC90Q02509 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OC90Q02509 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OC90Q02509 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OC90Q02509 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OC90Q02509 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OC90Q02509 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OC90Q02509 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OC90Q02509 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OC90Q02509 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OC90Q02509 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OC90Q02509 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OC90Q02509 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OC90Q02509 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OC90Q02509 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OC90Q02509 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OC90Q02509 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OC90Q02509 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OC90Q02509 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OC90Q02509 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OC90Q02509 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OC90Q02509 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OC90Q02509 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OC90Q02509 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OC90Q02509 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OC90Q02509 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OC90Q02509 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OC90Q02509 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OC90Q02509 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OC90Q02509 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OC90Q02509 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OC90Q02509 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OC90Q02509 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OC90Q02509 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OC90Q02509 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OC90Q02509 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OC90Q02509 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OC90Q02509 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OC90Q02509 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OC90Q02509 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OC90Q02509 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
OC90Q02509 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OC90Q02509 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OC90Q02509 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OC90Q02509 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OC90Q02509 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OC90Q02509 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OC90Q02509 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OC90Q02509 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OC90Q02509 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OC90Q02509 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OC90Q02509 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OC90Q02509 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OC90Q02509 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OC90Q02509 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OC90Q02509 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OC90Q02509 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
OC90Q02509 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
OC90Q02509 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms