Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms