Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms