Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms