Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms