Protein–RNA interactions for Protein: P56696

KCNQ4, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 4, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ4P56696 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNQ4P56696 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms