Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA3P52797 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms