Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOBEC3AP31941 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC3AP31941 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms