Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
ARID4AP29374 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID4AP29374 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID4AP29374 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID4AP29374 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID4AP29374 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID4AP29374 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID4AP29374 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID4AP29374 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID4AP29374 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID4AP29374 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID4AP29374 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID4AP29374 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID4AP29374 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID4AP29374 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID4AP29374 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID4AP29374 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID4AP29374 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID4AP29374 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID4AP29374 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID4AP29374 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms