Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2AP24928 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms