Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRKCHP24723 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRKCHP24723 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRKCHP24723 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRKCHP24723 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRKCHP24723 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRKCHP24723 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRKCHP24723 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRKCHP24723 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRKCHP24723 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRKCHP24723 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PRKCHP24723 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRKCHP24723 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PRKCHP24723 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PRKCHP24723 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRKCHP24723 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRKCHP24723 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRKCHP24723 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRKCHP24723 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRKCHP24723 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRKCHP24723 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRKCHP24723 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRKCHP24723 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PRKCHP24723 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKCHP24723 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRKCHP24723 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms