Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms