Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB1P16220 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB1P16220 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB1P16220 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB1P16220 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB1P16220 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB1P16220 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB1P16220 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB1P16220 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB1P16220 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB1P16220 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB1P16220 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB1P16220 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB1P16220 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB1P16220 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB1P16220 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB1P16220 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB1P16220 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB1P16220 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB1P16220 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB1P16220 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB1P16220 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB1P16220 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB1P16220 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB1P16220 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB1P16220 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB1P16220 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB1P16220 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB1P16220 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB1P16220 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB1P16220 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB1P16220 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB1P16220 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB1P16220 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB1P16220 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB1P16220 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB1P16220 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB1P16220 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB1P16220 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB1P16220 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB1P16220 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB1P16220 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB1P16220 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB1P16220 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB1P16220 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB1P16220 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB1P16220 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CREB1P16220 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB1P16220 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB1P16220 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB1P16220 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB1P16220 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB1P16220 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB1P16220 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB1P16220 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB1P16220 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB1P16220 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB1P16220 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB1P16220 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB1P16220 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB1P16220 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB1P16220 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB1P16220 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB1P16220 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB1P16220 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB1P16220 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB1P16220 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB1P16220 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB1P16220 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB1P16220 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB1P16220 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB1P16220 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB1P16220 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB1P16220 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB1P16220 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB1P16220 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB1P16220 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB1P16220 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB1P16220 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CREB1P16220 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB1P16220 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB1P16220 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB1P16220 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB1P16220 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB1P16220 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB1P16220 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB1P16220 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB1P16220 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB1P16220 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB1P16220 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB1P16220 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB1P16220 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB1P16220 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB1P16220 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB1P16220 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB1P16220 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB1P16220 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB1P16220 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB1P16220 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB1P16220 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms