Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms