Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms