Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMB4A4D0S4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMB4A4D0S4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMB4A4D0S4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMB4A4D0S4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMB4A4D0S4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMB4A4D0S4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMB4A4D0S4 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMB4A4D0S4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMB4A4D0S4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMB4A4D0S4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMB4A4D0S4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMB4A4D0S4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMB4A4D0S4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMB4A4D0S4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMB4A4D0S4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMB4A4D0S4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMB4A4D0S4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMB4A4D0S4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMB4A4D0S4 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMB4A4D0S4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMB4A4D0S4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMB4A4D0S4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMB4A4D0S4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMB4A4D0S4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMB4A4D0S4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMB4A4D0S4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMB4A4D0S4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMB4A4D0S4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMB4A4D0S4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMB4A4D0S4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMB4A4D0S4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMB4A4D0S4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMB4A4D0S4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMB4A4D0S4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMB4A4D0S4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMB4A4D0S4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMB4A4D0S4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMB4A4D0S4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMB4A4D0S4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMB4A4D0S4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMB4A4D0S4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMB4A4D0S4 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMB4A4D0S4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMB4A4D0S4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMB4A4D0S4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms