Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PARP3Q9Y6F1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PARP3Q9Y6F1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
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