Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E1

WASHC2C, WASH complex subunit 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2CQ9Y4E1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC27■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC27■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
WASHC2CQ9Y4E1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms