Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED23Q9ULK4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms