Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms