Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
KDM5BQ9UGL1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
KDM5BQ9UGL1 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms